Istanbul Aquarium ligger i Florya, ett kustnära område på Istanbuls europeiska sida, inne i Aqua Florya-komplexet vid Marmarasjön. Det ligger längre västerut än Sultanahmet och Taksim, men är lätt att ta sig till med Marmaray, pendelbuss eller bil.
Adress: Senlikkoy Mahallesi, Yesilkoy Halkali Caddesi nr 93, Bakirkoy, Istanbul, Turkiet. Hitta på kartan.
Närmaste landmärke: Aqua Florya Shopping Mall (inom samma komplex)